基因智能識(shí)別和報(bào)告自動(dòng)化軟件,是推進(jìn)醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床分子診斷自動(dòng)化和加速拓展分子診斷市場(chǎng)的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。分子診斷相關(guān)的檢測(cè)平臺(tái)眾多,按照檢測(cè)原理劃分大致可分為:熒光定量PCR,一代測(cè)序,片段分析,二代測(cè)序,核酸質(zhì)譜,固相芯片等。熒光定量PCR平臺(tái)是目前國(guó)內(nèi)分子實(shí)驗(yàn)室普及程度最高,配套試劑盒最多,已檢測(cè)/待檢測(cè)人群最大的平臺(tái)。在該平臺(tái)上可以開(kāi)展多種分子診斷臨床應(yīng)用,如病原體核酸檢測(cè)(新冠病毒,多重呼吸道病毒等),多種心血管藥物基因組基因分型等。基于此,本項(xiàng)目所開(kāi)發(fā)的軟件,以期實(shí)現(xiàn)與國(guó)內(nèi)市場(chǎng)上主流熒光定量PCR平臺(tái)完美兼容。此外,如何適配更多熒光定量PCR平臺(tái)的分子診斷應(yīng)用,如何對(duì)接醫(yī)院的His/Lis系統(tǒng),如何完成平臺(tái)數(shù)據(jù)下機(jī)后的結(jié)果自動(dòng)化判讀、自動(dòng)化錄入及報(bào)告生成,決定了熒光定量PCR分子診斷應(yīng)用的拓展規(guī)模和速度。
該軟件的主要功能如下:
1) 開(kāi)放性:兼容國(guó)內(nèi)IVD市場(chǎng)常見(jiàn)熒光定量PCR分子診斷試劑盒,包括病原體核酸檢測(cè)試劑盒(新冠病毒,多重呼吸道病毒等)和多種心血管藥物基因組基因分型試劑盒(氯吡格雷、華法林,他汀、葉酸,硝酸甘油等)。
2) 兼容性:軟件有專(zhuān)門(mén)配置管理頁(yè)面,可識(shí)別國(guó)內(nèi)外主流型號(hào)的熒光定量PCR儀器(ABI,羅氏,伯樂(lè),宏石等)下機(jī)數(shù)據(jù);可兼容不同電腦系統(tǒng)版本;可與國(guó)內(nèi)醫(yī)療機(jī)構(gòu)主流LIS系統(tǒng)的無(wú)縫銜接,實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化錄入。
3) 可視化:操作界面展示96/384孔板,整版結(jié)果用顏色直觀標(biāo)識(shí);每個(gè)孔可展示不同熒光通道的擴(kuò)增曲線;。
4) 智能判讀:根據(jù)導(dǎo)入的試劑盒判讀規(guī)則進(jìn)行自動(dòng)判讀??梢酝瓿纱罅繕颖窘Y(jié)果的分析,訓(xùn)練得到閾值向量,該閾值向量也可以在數(shù)據(jù)量有限的初期進(jìn)行人工賦值,對(duì)于異常數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)警。根據(jù)試劑盒類(lèi)型,可以進(jìn)行陰性、陽(yáng)性、雜合、純合、野生、異常等結(jié)果判讀。
5) 報(bào)告自動(dòng)化:在內(nèi)網(wǎng)環(huán)境下,整合病人基本信息和智能判讀結(jié)果,并可與不同Lis系統(tǒng)雙向通訊,實(shí)現(xiàn)報(bào)告的自動(dòng)傳輸和推送LIS,從而減少人工錯(cuò)誤,提高工作效率。
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